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Bem, me disseram que quando tenho apenas dois tratamentos não é necessário fazer o tukey pois se houver diferença, vai ser um tratamento ou o outro. Então não faço teste ou posso usar outro test?

Se estiverem cumpridos os pressupostos de aplicação de uma ANOVA paramétrica então nesse caso, não é necessário fazer comparações múltiplas, porque há só uma comparação em questão. O teste F nesse caso é igual ao teste T-student.